Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms