Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CGREF1Q99674 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms