Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS6KC1Q96S38 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms