Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LCORQ96JN0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LCORQ96JN0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCORQ96JN0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms