Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms