Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYTL4Q96C24 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYTL4Q96C24 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYTL4Q96C24 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms