Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms