Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKD2Q969F2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms