Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GTF3C6Q969F1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms