Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TTC9Q92623 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC9Q92623 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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