Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TOPBP1Q92547 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TOPBP1Q92547 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms