Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SMPDL3BQ92485 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMPDL3BQ92485 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms