Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
COPS9Q8WXC6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms