Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PARP9Q8IXQ6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms