Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP4Q86YS3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP4Q86YS3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP4Q86YS3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB11FIP4Q86YS3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB11FIP4Q86YS3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms