Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms