Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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