Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms