Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms