Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMBOX1Q6NT76 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms