Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NANOGP8Q6NSW7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms