Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms