Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DCAF6Q58WW2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCAF6Q58WW2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms