Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LETM2Q2VYF4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms