Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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CCDC142Q17RM4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC142Q17RM4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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