Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms