Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DDR2Q16832 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DDR2Q16832 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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