Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPROQ16827 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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