Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCSK7Q16549 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCSK7Q16549 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCSK7Q16549 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCSK7Q16549 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCSK7Q16549 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCSK7Q16549 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PCSK7Q16549 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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