Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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DDB1Q16531 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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DDB1Q16531 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDB1Q16531 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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DDB1Q16531 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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DDB1Q16531 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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DDB1Q16531 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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DDB1Q16531 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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DDB1Q16531 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DDB1Q16531 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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