Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK3Q16288 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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