Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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E2F4Q16254 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F4Q16254 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F4Q16254 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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