Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms