Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNIP1Q15025 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms