Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GAPVD1Q14C86 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms