Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GBX1Q14549 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GBX1Q14549 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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