Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK13Q14004 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK13Q14004 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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