Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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PDE7AQ13946 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PDE7AQ13946 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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