Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms