Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA9Q13797 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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