Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOFQ13790 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOFQ13790 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms