Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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