Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TUBA3CQ13748 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA3CQ13748 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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