Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TCIRG1Q13488 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TCIRG1Q13488 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TCIRG1Q13488 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TCIRG1Q13488 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TCIRG1Q13488 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TCIRG1Q13488 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCIRG1Q13488 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
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