Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
XRCC4Q13426 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
XRCC4Q13426 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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