Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TROQ12816 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TROQ12816 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TROQ12816 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TROQ12816 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TROQ12816 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TROQ12816 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TROQ12816 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TROQ12816 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TROQ12816 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TROQ12816 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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