Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARHGEF5Q12774 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF5Q12774 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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