Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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RASGEF1BQ0VAM2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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