Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C2orf54Q08AI8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C2orf54Q08AI8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms