Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC01490-201ENST00000548705 638 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms